På miljøområdet er der også indgået et delforlig i forbindelse med finansloven. Der afsættes 58 millioner kroner til vand- og naturprojekter i perioden 2007-2009, så 11 steder kan sikres renere vand og mere skov

50 millioner kroner går til såkaldte grønne partnerskaber, som Danmarks Naturfredningsforening, Friluftsrådet og kommunerne kan bruge på fælles projekter.
Danmarks Naturfredningsforening kalder aftalen for kortsigtet og kritiserer, at der kun er afsat penge frem til 2009. Hvis Danmark skal leve op til sine internationale miljøforpligtelser, er der brug for et tocifret milliardbeløb, påpeger foreningen.